Patek, Czapek & Cie основана в Женеве польскими эмигрантами Антонием Патеком и Франциском (Франсуа) Чапеком в 1839 году. Первая мануфактура Патека и Чапека, укомплектованная мастерами-поляками, производила до двухсот часов в год по индивидуальным заказам. В 1845 Чапек покинул фирму из-за конфликта с Патеком, и мануфактура стала называться Patek & Cie… 15 мая 1845 года место Чапека занял Жан Адриен Филипп — часовщик, изобретатель заводного механизма «без ключа». В 1851 Филипп стал полноправным партнёром Патека, и фирма приобрела «почти» современное название — Patek Philippe & Co… В товариществе Патека и Филиппа Филипп отвечал за производство и разработку новых моделей, а Патек занимался сбытом, путешествуя по миру и привлекая на сторону фирмы влиятельных заказчиков, в том числе правящих монархов. Одни из первых часов под новой маркой были преподнесены королеве Виктории во время всемирной выставки 1851 года в Хрустальном дворце.

В 1868 Patek Philippe выпустил первые в мире наручные часы-браслет, в настоящее время хранящиеся в музее фирмы.[1] За этим последовали многочисленные патенты и инновации — хронограф, вечный календарь, минутный репетир и т. п. В 1932—1933 фирма выступила в «часовом состязании» на стороне миллионера Генри Грейвза, изготовив по его заказу сложнейший на тот момент механизм. В 1999 часы Грейвза были проданы на аукционе Sotheby’s за 11 000 000 долларов США — это абсолютный максимум, когда-либо уплаченный за часы.

В 1901 году, когда оба титульных основателя давно умерли, фирму переименовали в Ancienne Manufacture d’Horlogerie Patek Philippe & Cie, S.A… В 1932 её приобрели братья Жан и Шарль Стерны, и тогда же установилось нынешнее название Patek Philippe S.A… В 2007 году фирмой владеют и управляют третье и четвёртое поколение дома Стернов — отец и сын Филипп и Тьерри Стерны. Все производства и музей фирмы по-прежнему располагаются в Женеве.[2] В производстве занято 220 человек, в современном каталоге фирмы 45 серийных механизмов 23-х калибров. Объём производства, с учётом исключительно высоких цен, остаётся небольшим — выпуск часов Patek Philippe за всю историю существования оценивается в 600 000 штук.